又是一个平静的日子，内裤爱好者八宝斋（永井一郎 饰）四面出击，惹得乱马（山口勝平 饰）、小茜、良牙（山寺宏一 饰）、珊璞（佐久間レイ 饰）等人纷纷加入进来，在镇上惹出巨大的骚动。正当众人闹得不可开交之时，一头裹挟着黑色杀气的大象突然袭来。它和美丽的主人向八宝斋发起攻击。与此同时，天空阴云密布，一艘巨船出现在空中。他们是来自…- 在参拜母亲坟墓的回程途中，真嗣（绪方惠美 配音）和葛城美里（三石琴乃 配音）遭遇了第七使徒的攻击，关键时刻2号机势如破竹挫败对手，真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾（宫村优子 配音）。与沉默寡言的绫波丽（林原惠美 配音）不同，明日香自信张扬，甚至有些自大，在和真嗣相处的日子里，彼此闹出不少的笑话。他们三人分别…